Phát sinh chủng loài của thực vật có hoa theo APG III (2009).[14]

Phát sinh chủng loài của thực vật có hoa theo APG IV (2016).[15]

Hiện còn 8 nhóm thực vật hạt kín còn sinh tồn:

• Amborella - loài cây bụi duy nhất ở New Caledonia
• Ceratophyllum - khoảng 6 loài[16] thực vật thủy sinh, có lẽ thân thuộc nhất như là các cây trong bể cảnh
• Chloranthales - vài chục loài cây có hương thơm với lá khía răng cưa
• Austrobaileyales - khoảng 100 loài[16] cây thân gỗ từ các nơi khác nhau trên thế giới
• Nymphaeales - khoảng 80 loài[16] - súng và Hydatellaceae
• magnoliids - khoảng 9.000 loài,[16] với đặc trưng hoa có các đặc điểm là bội số của 3, phấn hoa có một lỗ, và thông thường các lá có gân phân nhánh - chẳng hạn mộc lan, nguyệt quế và hồ tiêu
• eudicots - khoảng 175.000 loài,[16] với đặc trưng hoa có các đặc điểm là bội số của 4 hay 5, phấn hoa có 3 lỗ, và thông thường các lá có gân phân nhánh - ví dụ hướng dương, mao lương, táo tây và sồi
• monocots - khoảng 70.000 loài,[16] với đặc trưng hoa có các đặc điểm là bội số của 3, một lá mầm, phấn hoa có một lỗ, và thông thường các lá có gân song song - ví dụ cỏ, lan và cau, dừa

Mối quan hệ chính xác giữa 8 nhóm này vẫn chưa rõ ràng, mặc dù người ta đã xác định được rằng ba nhóm đầu tiên tách ra khỏi các dạng thực vật hạt kín tổ tiên là Amborellales, Nymphaeales và Austrobaileyales, theo đúng trật tự đó.[17]